甘肃省农业科学院蔬菜研究所前身始建于1938年甘肃省农业改进所园艺组；1958年9月甘肃农业科学院成立园艺研究所，设置蔬菜研究室；1969年10月，甘肃省农业科学院撤销时园艺研究所解散；1973年7月，园艺研究所恢复；1978年10月园艺研究所分解成立甘肃省农业科学院蔬菜研究所。

蔬菜研究所主要开展蔬菜、瓜类、食用菌等种质资源创新与利用开发、优良品种选育；高产优质蔬菜栽培技术研究与示范；设施蔬菜生产关键技术研究与设备开发；蔬菜生产新技术推广、技术咨询与培训等工作。目前设有西甜瓜研究室、茄果类（辣椒、番茄）新品种选育研究室、种质资源（黄瓜、南瓜、西瓜砧木、莴笋、分子育种）利用研究室、食用菌研究室、蔬菜栽培（栽培技术、栽培生理、设施工程、特色蔬菜）研究室。

全所在职职工51人，其中科技人员49人，具有高级职称38人，硕士以上25人，硕士研究生导师4人，甘肃省领军人才6人。建所以来先后鉴定验收并登记科研成果108项，选（引）育瓜菜新品种95个。获得各类成果奖励69项，其中国家级成果奖3项，省部级奖39项。出版学术专著10部，发表学术论文648篇。授权国家发明专利3项、实用新型专利29项、计算机软件著作权8项，国家植物新品种保护3项；制订甘肃省地方标准4项。育成新品种及配套栽培技术累计推广106.7万公顷。取得了比较显著的社会经济效益。

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